আইয়ুব খান প্রেসিডেন্টের দায়িত্ব দিয়ে পদত্যাগ করেন ১৯৬৯ সালে পূর্ব পাকিস্তানের গণঅভ্যুত্থানের মুখে আইয়ুবতার ১১ বছরের রাষ্ট্র পতিত্বের অবসান ঘটান পদটি থেকে পদত্যাগ করে।আইয়ুব দেশের সরকার প্রধানের দায়িত্ব নেওয়ার পর সেনাবাহিনীর সর্বাধিনায়কের পদে জেনারেল মুহাম্মদ মুসা খান কে নিযুক্ত করেছিলেন।
